1. Дора
2. Она выходила в дамскую комнату, когда Шерман убрал карбункул в коробку. Соответственно, она не знала, в какой именно коробке он лежит. Бадди и Сэм это знали. А вором были открыты все три коробки.

С другой стороны - это, конечно, очень слабое доказательство. Камень могли украсть и двое других, а открыть три коробки специально, чтобы бросить тень подозрения на Дору.

Думаю, что карбункул взяла Дора. Она выходила из комнаты, когда Шерман убирал камень и потому не знала, в которой из 3-х одинаковых коробок он лежит. Поэтому ей пришлось открыть все три.

Думаю, это сделал журналист, если предположить, что карбункл был фальшивым. Тогда только журналист и ювелир знали, что карбункл лежит в одной из коробок: когда Шерман им его показывал, то достал откуда-то из бумаг, а не из коробки; тогда же медсестра, которая вышла из библиотеки раньше, чем карбункл положили в одну из коробок, не знала точно, где лежит камень, и вряд ли стала бы его искать. Тогда остаются только ювелир и журналист. Если голубых карбунклов не бывает, то ювелир должен был понять, что Шермана обманули, но не стал об этом говорить. Журналист такими знаниями не наделён, и мог поверить в подлинность.

Однако как тогда Шерман мог знать, что это сделал журналист, если он думает, что карбункл настоящий.

Добавлю: заметил, что журналист высказал скептицизм в отношении подлинности камня. Тогда, если таковой все-таки настоящий, то вор - ювелир, потому что он мог убедиться в подлинности карбункла и украсть его, тогда как журналист в голубой карбункл не верил.

Шерман с удовольствием провёл бы полное обследование места преступления, но в этом не было необходимости. Как только он обнаружил пропажу, то сразу определил наиболее вероятного подозреваемого.
Шерман полистал записную книжку, потом сел в машину и направился к дому Доры Трит, приехав по адресу буквально через несколько минут после того, как медсестра сама вернулась домой.
- Вы решили бросить мне вызов, - сказал он, когда Дора открыла дверь. - Я знаю, что на самом деле вы не стали бы грабить меня по-настоящему.
Дора на секунду растерялась.
- Как вы узнали? - смущённо спросила она. - Да, я бросила вам вызов. Решила, что было бы неплохо возродить приключения голубого карбункула.
- Я так и подумал, что это шутка, - сказал Шерман с явным облегчением.
- Конечно, шутка.
Дора сунула руку в сумочку, вытащила оттуда маленький голубой камень и протянула его Шерману.
- Вам пришлось спешить, верно? В любую секунду я мог войти в библиотеку и поймать вас. И, тем не менее, вы обыскали все три коробки.
- А почему это не мог быть кто-то другой?
- И Сэм, и Бадди видели, как я положил карбункул в красную коробку. Но в тот момент вас в библиотеке не было. Вы единственная не знали, в какой именно коробке лежит карбункул.

Ответ 1 Наверное, Дора Дрит.
Ответ 2 Она единственная не знала, что Шерман положил камень в красную коробку, которая, вместе с двумя другими открытыми коробками, оказалась пустыми. Хотя, оставив открытыми ещё две коробки, на неё, таким образом, мог попытаться бросить тень подозрения каждый из других подозреваемых. Например, Сэм Пикеринг, заинтересован, потому что сказано, что у него было предчувствие, что вскоре появится третья статья о Шермане, за которые, он, наверное, получает гонорары и чем больше сенсация в статье, тем больше он заинтересован как автор. Естественно, к сожалению, ни о чём не говорит наличие при себе ювелирной лупы у, по-видимому, профессионального ювелира Бадди Джонсона. Скорее, подозрительно было бы, если бы её у него не оказалось.

А самое неприятное, для Шермана, что всё произошло на праздновании его Дня Рождения в кругу тех, кого он считал самыми близкими друзьями.